Pythonの隠れマルコフモデルライブラリGHMMのインストール

Pythonの隠れマルコフモデル(Hidden Markob Model)ライブラリである、GHMMのインストールとその使いかたについて紹介します。私の環境はUbuntuです。

GHMMのホームページ : ghmm.org

まずは依存するライブラリ群をインストールします。

$ sudo apt-get update 
$ sudo apt-get install build-essential automake autoconf libtool
$ sudo apt-get install python-dev
$ sudo apt-get install libxml++2.6-dev
$ sudo apt-get install swig

GHMMが公開されているレポジトリはSubversionでバージョン管理されているので、まずはSubversionをインストールします。

$ sudo apt-get install subversion

次に、Subversion上にあるレポジトリを以下のコマンドでダウンロードします。

$ svn checkout svn://svn.code.sf.net/p/ghmm/code/trunk/ghmm ghmm

最後に以下のコマンドでインストールを完了します。

$ cd ghmm
$ sh autogen.sh
$ sudo ./configure
$ sudo make
$ sudo make install
$ sudo ldconfig

と、ここまでが公式ホームページに載っているインストールの方法ですが、実際は./configureを実行すると、エラーメッセージが表示されます。
どうやら日本語フォントのせいで発生するようです。これに対応するには、
~/ghmm/ghmmwrapper/setup.py　を編集します。
下記の一文をsetup.pyの2行目に挿入してから、./configureを実行します。